La secuencia de aminoácidos determina la estructura primaria

El número y el orden de todos los residuos aminoácidos en un polipéptido constituyen su estructura primaria. Los aminoácidos presentes en péptidos reciben el nombre de residuos aminoacilo y ob-tienen su denominación mediante remplazar los suifjos -ato o -ina de aminoácidos libres por -il (p. ej., alanil, aspartil, tirosil). La nomenclatura de los péptidos está en función de los derivados del residuo aminoacilo carboxilo terminal; por ejemplo, Lis-Leu-Tir-Gln se llama lisil-leucil-tirosil-glutamina. Así, la terminación -ina en la glutamina indica que su grupo carboxilo α no participa en la forma- ción del enlace peptídico

Interacciones hidrofóbicas

El término “interacción hidrofóbica” (o hidrófoba) alude a la tendencia de compuestos no polares a autoasociarse en un ambiente acuoso. Tal autoasociación no está impulsada por atracción mutua ni por lo que a veces es denominado de manera incorrecta como “enlaces hidrofóbicos”. La autoasociación minimiza interacciones desfavorables desde el punto de vista energético entre grupos no polares y agua. Dado que los hidrógenos de grupos no polares como los grupos metileno de hidrocarburos no forman enlaces de hidrógeno, afectan la estructura del agua que los rodea. Las moléculas de agua adyacentes a un grupo hidrofóbico tienen restricción en cuanto al número de orientaciones (grados de libertad) que les permiten participar en el número máximo de enlaces de hidrógeno favorables desde el punto de vista energético. La formación máxima de múltiples enlaces de hidrógeno sólo puede mantenerse al aumentar el orden de las moléculas de agua adyacentes, con una disminución agregada de la entropía.

La segunda ley de la termodinámica establece que la energía libre óptima de una mezcla de hidrocarburo-agua está en función tanto de la entalpía máxima (por formación de enlaces de hidró- geno) como de la entropía mínima (grados máximos de libertad). De este modo, las moléculas no polares tienden a formar gotitas a fin de minimizar el área de supericie expuesta y reducir el número de moléculas de agua afectadas.

BIOGUIOQUIMICA: Las moléculas de agua forman dipolos.

BIOGUIOQUIMICA: Las moléculas de agua forman dipolos.: Una molécula de agua es un tetraedro irregular, un tanto asimétrico, con oxígeno en su centro (Fig.1). Los dos hidrógenos y los electrones...

Los enlaces covalentes y no covalentes estabilizan moléculas biológica.

El enlace covalente es la mayor fuerza que mantiene juntas a las moléculas. Las fuerzas no covalentes, aunque son de menor magnitud, hacen contribuciones importantes a la estructura, estabilidad y competencia funcional de macromoléculas en las células vivas. Estas fuerzas, que pueden ser de atracción o de repulsión, comprenden interacciones tanto dentro de la biomolécula como entre la misma y el agua, que es el principal componente del ambiente circundante.

Las moléculas de agua forman dipolos.

Una molécula de agua es un tetraedro irregular, un tanto asimétrico, con oxígeno en su centro (Fig.1). Los dos hidrógenos y los electrones no compartidos de los dos orbitales sp3-hibridados restantes ocupan los ángulos del tetraedro. El ángulo de 105 grados entre los hidrógenos difiere un poco del ángulo tetraédrico ideal, de 109.5 grados.El agua es un dipolo, una molécula con carga eléctrica distribuida de manera asimétrica en toda su estructura. El átomo de oxígeno fuertemente electronegativo empuja los electrones en dirección contraria a los núcleos de hidrógeno, lo que los deja con una carga positiva parcial, mientras que sus dos pares de electrones no compartidos constituyen una región de carga negativa local. 

Su fuerte dipolo y constante dieléctrica alta permiten al agua disolver grandes cantidades de compuestos cargados, como las sales.

Figura 1

Principales métodos y preparaciones usados en laboratorios de bioquímica

Estos métodos son idóneos para analizar los componentes presentes  en homogeneizados de células y en otras preparaciones bioquímicas. El uso secuencial de varias técnicas por lo general permitirá la purificación de casi todas las biomoléculas.

La BIOQUÍMICA puede definirse como........

La BIOQUÍMICA puede definirse como la ciencia de la base química de la vida (del griego,bios,“vida”). El principal objetivo de la bioquímica es el entendimiento completo, en el nivel molecular, de todos los procesos químicos relacionados con las células vivas (1).

Ciencias relacionadas con la Bioquímica:

• Toxicología
• Inmunología
•  Fisiología
• Farmacología
• Patología
• Microbiología
• Zoología
• Botanica

1. Bioquímica Ilustrada Harper - Robert K. Murray - 28va Edición